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实验室干货:L4440 Vector线虫RNAi干扰载体的使用注意问题!_克隆_dsRNA_AzoDye-

&使用注意问题

(一)载体构建阶段

克隆失败原因

酶切不完全:

避坑:优化双酶切条件,纯化后电泳验证片段大小 。

案例:插入片段与载体连接效率低时,需重新设计引物或更换酶切位点 。

连接效率低:

优化:控制插入片段与载体摩尔比,延长连接时间。

假阳性克隆:

验证:必须通过菌落 PCR 和测序确认插入片段。

Gateway兼容载体

L4440-Gateway 在 EcoRV 位点插入重组盒,可通过 BP/LR 反应快速克隆,避免传统酶切-连接 :

展开剩余83%

优势:简化克隆流程,适合高通量筛选。

注意:需在 PCR 引物中引入 attB 位点 。

(二)细菌转化与诱导

感受态细胞制备

关键步骤:

使用 CaCl₂法 制备 HT115 感受态细胞,冰浴 30 min 。

热激温度 42℃/90秒。

复苏后涂布含 Amp(100 μg/mL) + Tet(12.5 μg/mL) 的 LB 平板 。

试剂信息

英文名称:L4440 Vector

载体用途: 线虫RNAi干扰载体

载体大小: 2790bp

原核抗性: 氨苄青霉素(Ampicillin, Amp)

克隆菌株: DH5α

启动子: T7

复制子: pUC

质粒标签:lacZN, OriF1

表达宿主:线虫

诱导方式: IPTG

5'测序引物: 根据全序列设计

纯度:≥95%

储存条件:-20℃避光干燥

生产厂商:西安强化生物科技

&基本结构与设计原理

(一)

载体骨架:L4440是pBluescript质粒的改造版本,长度约2790 bp,属于高拷贝数质粒。

核心元件:

反向T7启动子:位于多克隆位点两侧,驱动DNA双链同时转录,生成互补RNA形成dsRNA。

多克隆位点(MCS) :185 bp区域,含多种限制性酶切位点,用于插入目标基因片段。

筛选标记:氨苄青霉素抗性基因,用于细菌转化后的阳性克隆筛选。

复制起点(ori) :支持高拷贝复制。

升级版本:新版本在T7启动子上游添加终止子,减少非特异性转录。

(二)功能机制

dsRNA生成:目标基因插入MCS后,在IPTG诱导下,宿主菌的T7 RNA聚合酶从两侧启动子转录,生成互补RNA链并形成dsRNA。

RNAi干扰原理:线虫摄食含dsRNA的细菌后,dsRNA通过肠道吸收,触发RNAi通路沉默目标基因表达。

&相关试剂

Carboxy-PTIO(cPTIO)

Tide Fluor 7叠氮化物

BXQ-1 CPG (1000 A)

AzoDye-3 CPG (500 A)

Azo Dye-3 PEG 10 炔烃

MitoTEMPOL线粒体靶向SOD模拟物

AP219 (Control Compound for AP39)

PE-iFluor 594 Tandem PE-iFluor 594

PE [R-Phycoerythrin] CAS 11016-17-4 PE

MitoSOX Red Mitochondrial Superoxide Indicator

Rosetta-gami 2(DE3) Chemically Competent Cell

TOP10 Electrocompetent cell 大肠杆菌电转感受态细胞

西安强化生物科技有限公司xxn对以上内容进行了系统整理!

本试剂用于科研领域,其他用途概不适用!

发布于:陕西省